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肠谈微生物组与多种东谈主类慢性胃肠谈（GI）疾病联系。肠易激概述症（IBS）是一种精深存在的疾病，其特征是反复出现腹痛或不适。IBS主要见于女性，并与粪便表情或频率变化联系91porn downloader，并基于主要便秘表情（便秘为主（IBS-C），泻肚为主（IBS-D）或混杂型（IBS-M））。 由于动物和东谈主类商榷之间显豁的脱节以及穷乏针对疾病特异性生理变化的概述多组学不雅点，因此很难详情肠谈菌群在疾病中的作用机理。 
近日，好意思国梅奥诊所消化内科和肝病科 Purna C. Kashyap商榷团队和明尼苏达大学生物科学学院 Dan Knights团队勾搭在 Cell上发表了题为 Longitudinal Multi-omics Reveals Subset-Specific MechanismsUnderlying Irritable Bowel Syndrome 的著作，商榷团队对IBS宿主生理进行了多组学测量的纵向商榷（gun弹枪浅宏基因组测序、16S rRNA基因测序、代谢组学商榷，细胞因子测量，转录组和甲基化组分析）最终详情了IBS亚类型特异性、症状联系的微生物组成和功能变异，其中一组已详情的微生物代谢家具变异子集与IBS联系的宿主生理机制联系。 通过Lasso回顾机器学习设施整合多个数据层，断然出的微生物代谢物变化的子集对应于与IBS联系的宿主生理机制。商榷团队将嘌呤代谢详情为一种新式IBS宿主-微生物代谢阶梯，同期嘌呤饥饿被阐明为潜在的IBS治疗靶标。 点评总结： 这项商榷主门径受了纵向多时辰点采样，针对IBS这类症状波动较为显豁的疾病商榷纵向多时辰点采样不错减少横断面商榷的采样偏差，减少入组病东谈主的数目但普及统计侦查的着力。不错看到商榷纳入的病东谈主并不好多，但领受平均值之后统计后果显豁。 另外商榷同期进行了多组学的检测，包括代谢组和黏膜转录组等，通过对宏基因组功能互异的分析以及代谢组的互异分析同期锁定了多项代谢特殊，尤其是次黄嘌呤的水平特殊。进一步对次黄嘌呤水平与宏基因组的菌种进行关联分析锁定了窒碍的联系菌，通过SV关联分析，在更细模范上筛选出了可能的功能基因区段。 这种组合款式提供了好意思满的商榷念念路，从东谈主群模范寻找疾病可能的代谢和生理机制，并进程多组学的关联分析锁定可能的菌种标志，再到讲求化筛选出可能的功能基因。 在菌群方面商榷领受了宏基因组和16S，对粪便样本领受宏基因组，对黏膜样本领受16S，因为黏膜样本含有较高的东谈主体DNA，16S更为合适。粪便样本的宏基因组径直领受和RefSeq89版块进行比对恰当，基因部分同期结合了序列比对和利用基因组数据径直索求恰当相结合。宏基因组测序简略提供菌株层面的分辨率，同期亦然后续结构变异关联分析的必要条款，跟着参考基因集的完善，中等测序深度的浅宏基因组将不错精深应用于这类商榷中。 全文先容 全文缩略词整理： 肠易激概述征（IBS） 便秘为主的肠易激概述征（IBS-C） 泻肚为主的肠易激概述征（IBS-D） 混杂型为主的肠易激概述征（IBS-M） 健康对照（HCs） 症状严重进程评分（SSS） 短链脂肪酸（SCFA） 靶向液相色谱-质谱（LC-MS） 5-羟色胺受体4（5-HT4R） 胆汁酸（BAs） 胆酸（CA） 鹅去氧胆酸（CDCA） 核磁共振氢谱（1H-NMR） 黄嘌呤磷酸核糖基调动酶（XPRT） 嘌呤核苷磷酸化酶（PNP） 缺失区（DR） 可变区（VR） Bray-Curtis互异（BCD） 不规则性（BCDI） 互异甲基化区域（DMR） 本文用到的实验设施汇总： 样本东谈主群和数据生成 18-65岁的IBS-C和IBS-D患者经过严格的筛查确诊患者入组。IBS-C和IBS-D受试者均相宜罗马III级范例。有腹部手术史(阑尾切除和胆囊切除以外)、被会诊为炎症性肠谈疾病、显微镜下结肠炎、腹腔疾病或其他炎症性疾病、在往日4周内使用抗生素、出血风险或服用加多出血风险的药物、往日一周准备秉承结肠镜检查、怀胎、筹算在商榷时间怀胎、是易受感染的成年东谈主以及年事在18岁以下或65岁以上的志愿者被排斥在外。 食品频率问卷（FFQ）和24小时饮食追念问卷 动物实验 小鼠实验 Ussing chamber 试验 Ussing Chamber，尤斯灌流室，离是商榷跨上皮转运的器用，可用于包括离子转运、养分物资转运及药物转运等的商榷。通过跨上皮转运的商榷，不错了解上皮的离子通谈机制、养分身分及药物透过上皮的收受、影响上皮樊篱功能以及通透性的因素等。本文的Ussing Chamber实验商榷了5-羟色胺(5-HT)对结肠上皮短路电流(ISC；一种响应肠谈分泌物的跨上皮离子流量的测量)的变化。 微生物组测序 QIAGEN PowerSoil 索求粪便和组织DNA 浅宏基因组使用HiSeq 2500（快速模式）单端读数为100 bp（1x100）和NextSeq150 bp单端读数（1x150）进行测序。 扩增子测序，对核糖体RNA基因的V4区进行测序，扩增子序列与来自归并细菌基因组的16S rRNA基因在shotgun测序法中使用BURST。 微生物组数据分析 宏基因组部分使用的是浅宏基因组，使用1x100或1x150单端，使用BURST以97%相似度和RefSeq（v86版块）进行比对，过滤比对测序深度低于1万reads的样本。KEGG正射图也不错从参考基因组中进行展望91porn downloader，并利用SHOGUN对展望的图谱进行扩充，以调动对低丰采基因的推断。 基因丰采部分是径直比对从refseq基因组中索求的KEGG恰当序列，并利用SHOGUN调动低丰采基因的展望） 在测试亚组之间的分类单位互异之前，删除了90％的受试者中不存在的分类单位。为了识别互异丰富的特征，使用FDR戒指值<0.25。 通过索求悉数健康对照（HC）与HC或IBS样本之间的成对互异来计算基于Bray-Curtis互异（BCD）的不规则性（BCDI），并存储这些互异的中位数。HC值的第90个百分位数用作断然与HC样品不同的微生物组样品的临界值。通过就地抽取每个HC对象一个样本并在这些样本中识别BCDI 500次，对第90个百分位数的临界值进行了明锐性分析。 此外，还计算了平均HC微生物组丰采的第90个百分位数临界值。 使用平均值不会改变第90个百分位数的临界值（0.63）。 代谢组学 血清和粪便样品的核磁共振代谢（1H-NMR）谱分析，测定粪便样品中丙酸、丁酸和醋酸的相对丰采，非靶向1H-NMR谱判别分析(PLS-DA)模子详情了IBS亚组和HC粪便样本之间的代谢变异。 通过LC-MS /MS进行胆汁酸分析 使用ACQUITY超高效液相色谱（UPLC）系统和Xevo G2-S四极飞行时辰（Q-TOF）质谱仪上对样品进行了分析。 通过GC-MS / MS进行SCFA定量 使用7000D 三重四极杆 GC/MS（(Agilent Technologies Ltd.）对SCFA进行定量分析。7000D 三重四极杆气质联用系统是 GC/MS/MS 发展史上迄今为止最为得胜的最新式号。使用着实的SCFA范例品画图了11点校准弧线和合并的QC样品。 通过LC-MS / MS进行色氨酸定量 色氨酸定量使用LC-MS/MS在WatersAcquity UPLC上进行，色谱柱为T3 C18柱(1 ×50 mm，1.7 uM)，联用WatersXevo TQ-S三重四极杆质谱仪。 细胞因子测量 使用多路Luminex定量分析IL-8，IFNγ，IL-10，II-18，IL-22，瘦素，血管内皮助长因子（VEGF），膜结合免疫球卵白（MIG），IL-1β，IL-17A，IL-1RA，IL-6和 TNFα。使用酶联免疫吸附测定（ELISA）对TGFb-1进行了定量。 RNA测序和分析 索求mRNA， 使用IlluminaHigh Seq-2000测序，使用MAP-RSeq v.2.0.0、edgeR 2.6.2、R包RITAN（https：//www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/RITAN.html）进行基因机损，互异抒发和旅途富集分析。 甲基基因组测序和分析 使用Illumina Infinium甲基化EPIC BeadChip评估基因组DNA中的全基因组甲基化，使用R软件包ChAMP 2.9.10、Combat设施、limma函数和Benjamini-Hochberg（BH）得到甲基化的CpG位点，使用R包RITAN，将与DMC或DMR联系的基因用于阶梯富集分析。 多组学数据整合 使用R中的Maaslin2软件包（）商榷了粪便微生物特征与粪便代谢家具之间的关联。使用最小丰采初始Maaslin2，将微生物特征的最小患病率分手熏陶为0.0001和0.5。 经FDR纠正的q值的阈值熏陶为0.25。 将线性混杂效应模子应用于与被熏陶为就地效应的受试者的关联。 用Lasso回顾机器学习设施拟合，断然基因-微生物组和基因-代谢物关联，该基因模子使用每个基因的基因抒发看成响应，并使用微生物组丰采或代谢物浓度看成展望因子。回顾设施是一种对数值型联贯就地变量进行展望和建模的监督学习算法，回顾分为Linear Regression线性回顾，Logistic Regression逻辑回顾，Polynomial Regression多项式回顾，StepwiseRegression慢慢回顾，Ridge Regression岭回顾，Lasso Regression套索回顾，ElasticNet回顾。其中，Lasso回顾设施是在统计学和机器学习中同期进行特征采用和正则化（数学）的回顾分析设施，旨在增强统计模子的展望准确性和可解释性，在实验中，岭回顾与套索回顾最初岭回顾。然而，淌若特征绝裁夺，而某些特征更窒碍，具有采用性，那就采用Lasso可能更好。 体内和体外次黄嘌呤消费实验 Mega培养基中培养细菌，使用LC-MS测定培养上清液中的次黄嘌呤水平，在6周龄的无菌Swiss Webster小鼠上进行了单菌落实验。 次黄嘌呤（Sigma-Aldrich）管饲喂养后第4天，正法小鼠并汇集盲肠实质物，使用Amplex Red黄嘌呤/黄嘌呤氧化酶测定试剂盒（Thermo Fisher）测定盲肠内次黄嘌呤和黄嘌呤的总浓度。 收尾分析： 一 纵向采样克服了跨部门微生物组商榷中的异质性 慢性胃肠谈疾病中肠谈微生物组的横断面商榷提供了高度动态的生态系统的快照。 除了饮食，药物使用，生计款式和其他环境因素的影响外，跟着时辰的荏苒微生物群的变化也可能响应疾病行径的变化。 该文通过对纵向数据进行二次采样，测试显着的分类单位，将单个时辰点的收尾与受试者平均所寥落据所取得的收尾进行比较，来评估纵向采样与横截面采样比拟对识别身分变化的影响时辰点。 比较不同时间点时，在各个时辰点不雅察到的HC和疾病组之间的分类单位丰采互异十分不一致，何况与平均数据中不雅察到的变化不近似。 当使用平均数据而不是单时辰点数据时，发现多个链球菌属物种的丰采显豁更高。与HC比拟，IBS-D中新近断然出的门合生植物的丰采要低得多。 咱们还发现，个体里面互异高于个体里面互异，这守旧了咱们对每个个体的纵向数据进行平均的设施（STAR设施，t侦查p<0.0001）。 这些发现突显了在慢性疾病中进行纵向采样的必要性，以可靠地识别使用横截面采样可能遗漏的微生物群变化。因此，咱们主要回报时辰平均数据的发现。 最近的一项商榷进一步解说了这少量，该商榷标明，在多个采样时辰点使用平均值时，常用的“组学”设施更为准确。  
二 纵向采样揭示了跟着时辰的荏苒，IBS-C微生物群具有更大的可变性 与HC和IBS-D受试者比拟，IBS-C患者的粪便微生物群组成随时辰发扬出更大的变异性。 此外，与IBS-D样本比拟，平均IBS-C粪便样本的香农万般性更高（ANOVA，Tukey HSD p值为0.016）。 
粪便样品中结肠黏膜的微生物组成与腔微生物群有显着互异。与HC比拟，IBS患者的粘膜联系菌群的特征是变形杆菌水平显豁较高。与IBS-D或HC比拟，IBS-C患者的与黏膜联系的微生物菌群与其各自的腔内微生物菌群相似性较低。这可能响应出IBS-C患者菌群的迁良晌辰较长，而社区之间有更多的时辰分化。 此外，IBS-C患者的粘膜联系菌群的个体内变异性随时辰变化更大，这与咱们在腔菌群中不雅察到的相似。 
三IBS症状严重进程与肠谈菌群的功能变化联系 在特定采样点使用IBS SSS(0-500)回报IBS的严重进程，IBS SSS是腹痛强度、频率、肿胀、对排便习气的不悦以及IBS对一般生计的影响的积攒度量。咱们不雅察到重度IBS-D（SSS>300）中跨越20种乳杆菌的相对丰采高于轻中度IBS-D（SSS<300）。而且这与受试者食用益生菌或乳成品无关。 在粪便宏基因组学功能富集分析时，咱们发当前FDR中74个KO与严重的IBS-C联系，而44个与严重的IBS-D联系。 重度IBS-C和IBS-D中均发现了酒精脱氢酶（ADH）的KO阶梯，且在重度IBS-C和IBS-D比轻中度IBS中高。 酒精脱氢酶（ADH）裸露与双歧杆菌和链球菌属呈正联系。这些数据标明ADH活性可能与腹痛联系，腹痛是IBS-C和IBS-D共同的主要症状。 
四 代谢组学与生理学收尾陈说了肠谈微生物群代谢对胃肠功能的影响 H1核磁共振（NMR）光谱裸露，与HC比拟，IBS-C患者粪便样本中的短链脂肪酸（SCFA）丙酸酯，丁酸酯和乙酸酯显着裁减。与腔内代谢家具一致，与HC组比拟，IBS-C组的结肠黏膜活检样品中的乙酸盐（通过气相色谱-质谱[GC-MS]测定）也显着减少。，SCFA的这些互异与膳食纤维的总摄入量无关，因为这在各组之间莫得显着互异。 
Ussing chamber 试验收尾标明水分流奉陪离子通量，何况分泌减少会导致便秘中粪便含水量裁减。违犯，加多的离子通量可导致分泌更多的水，导致泻肚。色胺均显着加多了结肠分泌且在各组之间莫得显着互异，标明，IBS患者和HCs的结肠上皮简略由色胺引起的液体分泌，因此不雅察到的变化可能是由于色胺的丰采变化导致。 
进一步使用靶向液相色谱-质谱（LC-MS）设施商榷了粪便样品中色胺和其他色氨酸代谢物的变化。发现，IBS-D患者粪便样品中的色氨酸和色胺皆显着加多，因此可能部分归因于IBS-D粪便中水分的加多。咱们证实这些代谢物的变化与卵白质摄入的饮食互异无关。 
使用LC-MS / MS咱们IBS-D患者粪便样品中未结合的低级BA含量显豁较高，而IBS-D患者粪便样品中未结合的低级BAs含量显豁较低。与HC和IBS-C受试者比拟，IBSD中个体低级共轭和非共轭BA和DCA-S的量更高。由于像CDCA这么的羟基化低级BA可能会加多结肠分泌，因此讹诈Ussing chamber测试了CDCA在无菌小鼠结肠黏膜下黏膜基层制剂中的作用，论断守旧了CDCA水平升高在加多IBS-D患者粪便中水分含量方面的生理作用。 五 聚会多组学分析详情了IBS中的新式微生物代谢阶梯 领受了非靶向代谢组学设施来断然可能导致IBS病理生理变化的新式微生物阶梯。基于无考虑1H-NMR光谱图的潜在结构判别分析（PLS-DA）模子的投影详情了IBS亚组和HC粪便样品之间的代谢变化。 与HC比拟，IBS-C患者粪便样品中的赖氨酸，尿嘧啶和次黄嘌呤均显着裁减。 IBS-D患者的次黄嘌呤含量也较低，尽管与IBS-C的兴味兴味不同。 
分析IBS和HC患者粪便样本中次黄嘌呤联系的宏基因组学功能，发现IBS-C中的黄嘌呤脱氢酶/氧化酶（XO;1.17.1.4）和黄嘌呤磷酸核糖基调动酶（XPRT; 2.4.2.22）阶梯相关于HC有所升高。 XPRT从黄嘌呤单磷酸中开释出黄嘌呤，这是抢救嘌呤的第一步。 不才游，XO是一种具有低底物特异性的酶，可作用于黄嘌呤或次黄嘌呤以产生尿酸。这些较高水平的XPRT和XO模块标明，IBS患者中肠谈菌群对嘌呤的阐明作用加多。  
进一步检查了宏基因组的KO分析，以探索次黄嘌呤代谢的两个方面，即其在转变上皮能量景况中的作用以及在假设的氧化剂作用下生成H2O2和超氧阴离子。 与HC比拟，IBS-C粪便中C氧化酶的丰采显豁更高。 真谛的是，IBS-C中的超氧化物复原酶（1.15.1.2）升高，这可能响应了IBS-C肠谈微生物组应酬氧化应激的才能增强。在XO活跃的情况下，这可能是必要的。 
要而论之，这标明IBS患者的微生物组对次黄嘌呤的利用和阐明才能增强，这与IBS-C粪便中次黄嘌呤水平的裁减是一致的。 六 胆汁酸，丁酸和次黄嘌呤代谢联系 为了进一步陈说微生物对IBS中断然的代谢物丰采的孝顺，最初基于线性模子（Maaslin2; ）进行了径直多元联系分析。这详情了HC样品有60种窒碍的代谢物种类联系性，IBS-C有28种，IBS-D有46种。 悉数组均无联系性。 HC和IBSC或IBS-D中存在12个。 IBS-C和IBS-D子组皆存在两种联系性。 
尽管以上联系设施使咱们简略识别粪便代谢物互异的潜在微生物驱动因素，但无法识别可能与检测到的代谢物互异联系的特定微生物基因。因此，咱们使用最近描绘的将结构可变的基因组区域与代谢物丰采联系联的设施（SV关联），测试了可能导致各组之间代谢输出变化的特定细菌基因组区域。 七 微生物代谢有助于次黄嘌呤水平 为了更潜入地了解微生物组在裁减次黄嘌呤水平中的作用，采用了与Lachnospiraceaesp的基因组相似性采用了2个Lachnospiraceae菌株进行无菌小鼠实验，收尾标明现定植了Lachnospiraceae sp的小鼠的盲肠内次黄嘌呤水平显豁裁减。 与长双歧杆菌定植的小鼠比拟为2_1_58FAA（图4E）。 由于旧例使用次黄嘌呤水平会加多，这标明微生物详情的次黄嘌呤水平是微生物分娩与消费之间均衡的收尾。 八 IBS患者爆发时肠谈微生物组和微生物代谢家具的改变 IBS是一种症状严重进程随时辰变化的慢性疾病，大多数患者会出现片霎的症状恶化。前边纵向分析详情了肠微生物组与IBS患者症状严重进程之间的潜在策动。对个别回报中裸露恶化时汇集的粪便样本进行分析，与非爆发基线组合IBS样本比拟，爆发期样本裸泄露更高的BCDI），与各个IBS子组的平均样本比拟，爆发期样本的Shannonα万般性更低（图5C）。 在将IBS患者看成一组时以及在IBS-D和IBS-C患者中，特定细菌类群皆与耀斑显着联系（IBS-D和IBS-C患者为168种，IBS-C为40种，IBS-D为7种）与各自平均基线样本比拟，来自Mann-Whitney U侦查的q<0.1（表S2）。 这些窒碍物种在爆发时间险些精深减少。发现包括色胺，CA和CDCA在内的分泌代谢物在亚组中升高爆发时IBS患者的比例（BA为6/11，色胺为4/11）。 这些不雅察收尾标明，不同患者的症状恶化可能是私有的微生物和代谢特征。  
九 微生物组和代谢组学数据与转录组学和表不雅遗传学互异的整合揭示了IBS中新式的宿主-微生物组相互作用 关于大多数慢性疾病，IBS的病理生理是多因素的，其来自宿主阶梯，微生物阶梯和宿主-微生物共代谢。 为了详情微生物代谢对宿主功能的影响，咱们最初比较了在结肠活检组织中不雅察到的转录和表不雅遗传学变化。 还通过构建跨组学联系汇集，将转录组数据与代谢物和微生物群的丰采相集聚，从而以无针对性的款式，使用这些数据来详情推定的宿主-微生物-代谢相互作用。  
十一 多组学集成详情结肠上皮中的嘌呤饥饿是潜在的新机制IBS 前边详情了IBS-C和IBS-D中粪便次黄嘌呤的含量显着裁减，详情了微生物次黄嘌呤的降解导致肠谈次黄嘌呤的水平裁减，并详情了功能性变化，标明IBS-C粪便中微生物组导致嘌呤降解的加多。 关联词，由于次黄嘌呤是宿主-微生物共代谢物，因此其库可同期受到微生物和宿主代谢的影响。 其实，肠上皮细胞的嘌呤重新合成才能有限，而是主要依靠救济阶梯进行腺苷酸的生物合成，因此，为了详情由于次黄嘌呤池的消费而导致宿主的继发效应，需要进一步阐明嘌呤救济阶梯中可能的转录变化。嘌呤救济阶梯中的第一个基因嘌呤核苷磷酸化酶（PNP）在IBS-C和IBS-D中均抒发高2倍。在IBS患者中PNP抒发呈与次黄嘌呤水平呈负联系。窒碍的是，宿主遗传学的变异不厚爱基因抒发的这些互异，因为Illumina全局筛选阵列裸露XDH和PNP中的单核苷酸多态性（SNP）在IBS亚组和HC之间莫得互异踱步。总之，这些发现漠视了一种模子，其中微生物群和宿主的嘌呤核苷酸在结肠组织中教唆代谢应激。反过来，这可能领悟过加多嘌呤救济而导致代偿性反应。 使用这种多组学不雅点，咱们建议低水平的嘌呤核苷酸可能导致较低的上皮能量景况和粘膜熏陶才能，这可能部分是IBS的病理生理基础。 
国厂偷拍在线播放商榷论断 在这项商榷中，咱们描绘了在不同IBS亚型患者的宿主生理情况下，对肠谈微生物组，代谢组，宿主表不雅基因组和转录组进行概述纵向多组学分析的收尾。IBS-D患者活检中基线结肠分泌加多，这标明上皮运载的固有变化或促进液体分泌的代谢家具加多。 不雅察到的促分泌素（举例主要的BA CDCA和细菌代谢物类胰卵白酶）的加多标明，较高水平的微生物群联系分泌化合物可能会导致IBS-D分泌加多。 三组结肠活检样本之间对色胺的分泌反应穷乏显着互异，这进一步得到了守旧，淌若结肠上皮存在固有颓势，这是不错预期的。 先前的商榷标明，BA收受不良驱动了IBS-D的肠谈分泌加多，然而在该商榷中，继发性BA与原发性BA并存的加多并莫得加多，这标明原发性BA的微生物生物转变减少可能至少部分地驱动了这种作用。通过进一步有针对性地整合多个宿主和微生物组数据层，详情了嘌呤代谢的宿主-微生物阶梯，这可能在IBS的病理生理中起窒碍作用。 商榷兴味兴味 这是初次将次黄嘌呤与IBS发病机制策动起来，包括先前对动物模子进行的致生菌商榷。这诠释了在东谈主类中领受多组学测量以断然可能依赖于基因抒发中东谈主类特异性反应的潜在疾病机制的联系性。由于黄嘌呤氧化酶阻碍剂别嘌呤醇（用于治疗痛风）和硫嘌呤（用于优化炎症性肠病治疗）的可用性，次黄嘌呤是有诱骗力的药物靶标。 该商榷为改日的商榷提供了多个新的治疗靶标。IBS-D患者中BA显豁减少的微生物生物转变不错使用详情的微生物菌群进行治疗，相同，在IBS-C患者中，细菌SCFA和/或色胺的产生加多可能是可行的治疗政策。 临了，在肠谈内局部刺激微生物次黄嘌呤的产生或阻碍黄嘌呤氧化酶将是一种加多腔次黄嘌呤的量而莫得全身作用的新设施，何况可能对孤苦于疾病亚型的IBS有意。 商榷的局限性 商榷存在一些局限性。本文主要关爱结肠微生物组，但咱们知谈小肠可能在IBS症状的产生中起窒碍作用。需要特意针对小肠微生物组的纵向商榷来补充发现并增进对IBS的交融。 福利行径和本领膨胀 本文的浅宏基因组测序有考虑是针对16s分辨率和宏基因组高资本之间的一个折中有考虑，通过裁减测序深度，然而物种的分辨率并莫得低于一般宏基因组（精深5~10G数据量）。 经过几个月的研发的测试，谷禾健康推出浅宏基因组测序分析办事，每个样本数据量不低于100万reads，欠亨过拼接拼装，径直基于秀雅基因的参考基因组设施进行种属丰采分类。结合其到菌株的物种分类和丰采数据可较16s有考虑下的PICRUST愈加准确的展望基因组成。 浅宏基因组分析实质 
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